Похоже, что в режиме поиска MySQL fulltext имеет значение поля FT_MIN_WORD_LEN в глобальных настройках мускула.. Я как раз тестил на трёхсловном SEX .. FT_MIN_WORD_LEN - по умолчанию стоит 4
В режиме поиска просто MySQL - таких проблем не наблюдается - фильтрует по S , SE и т.д.
пока вроде разобрался... буду тестить
Спасибо