1. менять можете как угодно, главное что б потом реврайт поменял это в такой вид который поймет скрипт.
viewtopic.php?p=134441#p134441
тут еще примеры
2. не понимаю с какой целью и что от этого изменится, но опять же смысл тот же - можете делать как угодно, главное, если вы юзаете rot_in.php, что б по итогу его дернуло с нужным пармтером, а как вы это делаете - никакой разницы нет.
3. не обязательно, но эти скрипт используют эту либу. конечно вы можете переписать те куски кода без использования этой jquery.
Замена моментов в скриптах
Re: Замена моментов в скриптах
Don't forget to run script update